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1、 2003年机构改革后，县农业局行政机关内设7个职能股室，即：办公室、政工股、计财股、科教股、法规股、种植业股、经济作物股、绿色食品管理办公室。

2、3个全额预算事业单位，分别为县农业技术推广中心（副局级）、县农业行政执法大队、县农广校；差额预算单位4个，分别为县原种场、县果园场、县仙人台茶场、县农科所。

3、企业化管理的单位3个，分别为县种子公司、县水果公司、县农业综合服务公司。